研究示意图。图片来源:《自然·微生物学》杂志
科技日报记者 刘霞
一个包括美国太平洋西北国家实验室在内、由全球近50个机构组成的国际联盟,成功绘制出了首份全球土壤病毒(GSV)图谱。该图谱对全球土壤病毒圈进行了全面描述,阐释了土壤病毒对全球生物地球化学过程可能的影响,并揭示了有望在哪些领域进一步开展土壤病毒生态学研究等重要信息。相关论文发表于新一期《自然·微生物学》杂志。
研究表明,土壤病毒层对人类和环境健康具有重要影响。然而,科学家对全球土壤病毒的分布、活动,以及与土壤微生物组之间相互作用的理解仍然有限。
最新完成的GSV图谱综合了来自全球2953种土壤的基因组信息,其中包括以前无法获得的1552个样本,以及616935个从未在实验室中培养过的病毒基因组。此外,这份最新图谱不仅描述了土壤病毒在全球生物地球化学过程中的可能作用,还涵盖了土壤病毒的各种微生物宿主、与土壤碳循环相关的关键功能,以及对理解土壤生态学至关重要的病毒代谢。
研究结果显示,95.8%的土壤病毒基因功能未知,仅有2.78%的病毒序列能与已知宿主相匹配,这进一步凸显了土壤病毒圈的多样性。研究团队指出,鉴于土壤病毒存在大量功能未知的基因,急需对土壤病毒圈开展进一步调查。调查内容将包括短距离内病毒群落的巨大变化、对土壤生物地球化学很重要的多种微生物宿主,以及参与碳循环和其他重要过程的特定病毒基因。
研究团队计划将GSV图谱作为一种新的公共资源向科学界开放,鼓励科学家提出并测试各种新假设,以推动解决病毒生态学领域面临的迫切挑战,如新型疾病的出现、疫苗失败,以及耐药性问题等。